Ngày 2-2, Ban kỷ luật Liên Đoàn bóng đá Việt Nam đã ra các Quyết định kỷ luật đối với những vi phạm tại vòng tứ kết Cúp Quốc gia - Nhựa Hoa Sen 2012.
Quyết định phạt Sài Gòn FC 50 triệu đồng và trận đấu tiếp theo của Sài Gòn FC phải thi đấu trên sân nhà không có khán giả, do để xẩy ra lộn xộn, ẩu đả trong trận đấu giữa Sài Gòn FC - Thanh Hóa tại lượt trận vòng Tứ kết Cúp Quốc gia, ngày 29-1-2012 trên sân vận động Thống Nhất.
Bên cạnh đó, Ban kỷ luật phạt 10 triệu đồng và đình chỉ thi đấu 2 trận kế tiếp ở Cúp Quốc gia đối với Lê Bật Hiếu (24) của Thanh Hóa; phạt Thanh Hóa 2 triệu đồng do có 5 cầu thủ bị phạt thẻ vàng trong trận đấu trên.